蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

交联组学——绘制蛋白质-蛋白质相互作用的新时代

罗杰和杰夫·兰尼什

蛋白质组学的一个主要目标是弄清楚蛋白质如何通过网络和复合物相互作用。集成化学交联、质谱和计算方法 (CXMS) 的发展最近已成为研究蛋白质相互作用的强大技术，并有可能显着推进蛋白质相互作用图谱领域的发展。鉴定出的交联肽（通过特定交联剂连接的两个肽）可用于推断蛋白质-蛋白质相互作用的位点，并根据交联剂的特性对相互作用位点施加距离限制。最近关于大型组合内相互作用图谱的报告，例如 15 个亚基 RNA 聚合酶 II-TFIIF 复合物 [EMBO J 29, 717-726]、53 个亚基核糖体 [JPR, 10(8): 3604-3616] 和 12 亚基 RNA 聚合酶 II [MCP，mcp.M111.008318] 的部分纯化制剂表明 CXMS 领域已经成熟，其用于绘制大型复合体中蛋白质相互作用的用途很快就会变得更加广泛常规。CROSSLINKOMICS 使用质谱和计算方法以高通量和公正的方式识别化学交联的肽，它正在成为一种新的、有前途的组学，有可能彻底改变蛋白质-蛋白质相互作用的研究。