食品学：微生物学、安全与卫生杂志
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使用基于培养和巢式 PCR-DGGE 指纹图谱方法的群体研究评估巴氏灭菌肉尸体净化处理后存活的微生物群落多样性

Bassirou Ndoye、Xianqin Yang、乐罗关、Khalifa Ababacar Sylla、Mamoudou H. Dicko、Ibrahima Ndoye、Alfred S. Traore、Amadou Tidiane Guiro、Colin O. Gill

测定微生物区系的多样性是为了评估加拿大一家大型肉类包装厂对巴氏灭菌肉胴体进行净化处理的有效性。主要目的是表征经过热处理和 DNase-I 处理的样品相对于未经处理的巴氏灭菌肉屠体样品中存活的细菌多样性。基于培养的方法与巢式 PCR-DGGE 指纹分析方法相结合，以量化每个样品中的少量细菌存活率。使用 DGGE 参考标记，通过 DGGE 和基于培养的方法检测到7 个属（假单胞菌属、葡萄球菌属、丙酸杆菌属、金黄杆菌属、黄杆菌属、拉尔斯顿氏菌属、类芽孢杆菌属）。三种（唾液链球菌、藤黄微球菌和肠膜明串珠菌））仅在基于培养方法的纯培养物中发现。使用实际样品中的 DGGE 标记菌株和条带，通过 PCR-DGGE 发现了超过 15 个属，表明该技术确定的多样性最高。相比之下，通过基于培养的方法检测到的物种数量最多（在 34 个热处理和未处理的样品中分别为 29 和 88）。肠杆菌科中的五种大肠杆菌分离株使用电镀方法在未经处理的样品中检测到了这些细菌，这证明了通过去污和热处理加工肉类样品的有用性。然而，大多数基于培养的无法识别的物种或属几乎都可以通过 PCR-DGGE 检测到，证实了结合培养依赖和独立方法来完整分析食品样品中细菌的有效性。