蛋白质组学与生物信息学杂志
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Epac 诱导的人 SH-SY5Y 神经母细胞瘤细胞蛋白质组的改变

Even Birkeland、Gyrid Nygaard、Eystein Oveland、Olav Mjaavatten、Marie Ljones、Stein Ove Doskeland、Camilla Krakstad 和 Frode Selheim

迄今为止，人类神经母细胞瘤细胞系 SH-SY5Y 的蛋白质组由 1029 个独特的蛋白质组成。通过使用亚细胞分级分离、SDS PAGE 和 nanoLC-Q-TOF-MS/MS，我们将蛋白质组扩大了 72.2%，从而产生了 3707 种独特的蛋白质。

已知神经母细胞瘤肿瘤细胞分化的阶段会影响患者的预后，高分化阶段与良好的预后相关。为了阐明 cAMP 在 SH-SY5Y 神经母细胞瘤分化中的作用，我们使用选择性 cAMP 类似物来激活 Epac 和 PKA。

我们发现 Epac 的激活会诱导肌动蛋白和微管蛋白聚合以及神经突生长，而 PKA 的激活则不会。Epac 刺激的效果可通过 ShRNA 敲除 Epac1 来消除。

使用细胞培养物中氨基酸的稳定同位素标记 (SILAC) 和质谱分析来揭示 Epac 激活对 SH-SY5Y 蛋白质组的长期影响。我们发现 101 个表达蛋白上调，74 个表达蛋白下调。上调的蛋白质通常与神经元细胞分化和粘附相关，而下调的蛋白质通常参与 RNA 加工。我们得出结论，cAMP 诱导的人神经母细胞瘤 SH-SY5Y 细胞的形态和生化神经元分化是由 Epac 介导的。