蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

探索序列和结构特征在确定 AGC 激酶蛋白家族灵活性中的相互作用:一种生物信息学方法

阿米特·库马尔·巴纳吉、尼利玛·阿罗拉、瓦拉坎塔姆·普拉尼萨和 USN Murty

在本研究中,数据挖掘方法用于生成关联规则,用于根据各种导出的序列和结构特征预测平均灵活性。使用分类和回归树 (CART) 计算了 21 个参数,并针对属于小鼠和人类的 AGC 激酶家族的 115 个序列计算了它们的可变重要性。研究发现,β 转数对平均柔韧性的影响最大,而总 β 链对平均柔韧性的影响最小。了解变量的重要性将被证明是有用的,可以作为氨基酸序列灵活性的简单预测因子。这将有助于更好地理解平均灵活性背后的现象,从而为合理设计治疗方法铺平道路。

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