免疫组学研究

免疫组学研究
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国际标准期刊号: 1745-7580

抽象的

小鼠模型肺中凝溶液胶蛋白的遗传调节及其潜在的广谱生物学功能

刘晓云、冯和林、朱家谦、Rachel Stein、黄悦、焦艳和朱晓东

关于凝溶胶蛋白的潜在生物学功能及其与人类免疫系统、疾病和其他饮食关系的关系,已经进行了大量的研究。我们研究的目的是确定调节血清溶液蛋白的遗传作用,并使用明确的作用因此,我们选择了C57BL/6J (B6) 和 DBA/2J (D2) 祖先后代的BXD 重组近交 (RI) 菌株。肺中的全基因组基因表达用于eQTL作图。生物信息学工具和基因分型数据用于候选基因分析。基因网络和相关过程用于评估凝溶胶蛋白和生物性状之间的关联性。数据表明,9号上染色体的eQTL覆盖21Mb至30Mb之间的基因组区域,在凝溶胶表达水平的调节区域中发挥着重要作用。该内遗传元件的分析表明,Ncapd3是最受青睐的候选基因。其表达水平与凝溶胶表达水平具有两个SNP (rs13480109)基因型的酪品系之间调节区凝溶胶蛋白的表达水平Ncapd3显示出显着差异。另外的关联分析表明溶胶蛋白可能具有广泛的凝溶胶蛋白表达水平。凝溶胶蛋白的表达与多种生物学功能基因具有很多相关性。这些高度相关的基因主要用于蛋白质结合。凝溶胶蛋白的表达还与多种已知的免疫表型水平相关这些数据对我们目前对凝溶胶蛋白生物学功能的了解做出了重大贡献。

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