蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

甲酸链霉菌KY5的基因组挖掘，用于潜在药物（如天然产物）表征

Mohibullah Shah*、Sana Gul、Adnan Amjad、Muhammad Sameem Javed、Batool Fatima、Haq Nawaz、Jaweria Ishaq

链霉菌属是各种具有临床意义的生物活性代谢物的来源。在分类学上，蚁形链霉菌KY5 是一个新的、不同的物种。S. formicae KY5 的完整基因组序列可在公共 DNA 序列数据库中获取，用于不同的分析。基因组序列的可访问性为探索这种独特的链霉菌物种的次级代谢物潜力提供了绝佳的机会。在本研究中，我们利用先进的生物信息学资源来注释 S. formicae KY5 的全基因组序列。应用生物信息学工具来定位隐藏在其生物合成基因簇 (BGC) 下的所有次生代谢物。发现 S. formicae KY5 通过指定的基因组编码来合成不同的和各种次生代谢物。预测分析表明该菌株有 34 个基因簇来编码潜在的次生代谢产物。由于与其他药物的结构相似，我们扫描药物银行数据库，从PDB中检索相似度最高的药物靶点和药物进行分子对接。通过分子操作工具进行分子对接分析，评估化合物的类药潜力。从 S 中预测出三种类似化合物的药物。