急诊医学：开放获取
开放获取
国际标准期刊号: 2165-7548
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约瑟夫·F·恩迪桑
抽象的
迄今为止， 肯尼亚的薯蓣（山药）是一种被忽视的作物，尽管它具有作为食品和药物来源的潜力。对被忽视的作物（特别是薯蓣）的研究是提高科学界和政策制定者对此认识的可靠方法。据报道，几种不同属的病毒可感染山药（薯蓣属）。然而，感染山药的病毒的全部多样性仍有待探索。
高通量测序 (HTS) 和 POX 标记方法的使用正逐渐用于发现新的植物病毒基因组和植物代谢过程。
在这项研究中，我将在山药上使用高温超导来确定是否存在任何未发现的病毒，从而限制山药种质的国际分布。这一发现将有助于发现新的病毒序列。将测试三十一（31）份山药样品，并暂将其命名为病毒“山药病毒Y”（YVY）。当它们在代谢中实现拟南芥过程时，将使用过氧化物酶标记来测试可能带来突变的代谢反应。生物。两种 YVY 病毒分离株的完整基因组序列将被组装，并进一步发现五个开放阅读框（ORF）。ORF1编码一个大的复制相关蛋白，ORF2、ORF3和ORF4构成假定的三基因块蛋白，ORF5编码一种假定的外壳蛋白，因为山药含有富含蛋白质的薯蓣苷。考虑到 Betaflexiviridae 科的物种划分标准，YVY 应被视为 Betaflexiviridae 科中的新病毒种。需要进一步的研究工作来了解这种新病毒与任何症状和产量损失的关联及其对无病毒种薯生产的影响。
关键词： RNA测序；病毒检测；β柔韧病毒科；下一代测序；高温超导
这项工作将于 2020 年 6 月 24-25 日在第六届世界药用植物和海洋药物大会（2020 年药用植物-网络研讨会）上发表
介绍
山药 ( Dioscerea spp) 是东非种植的最重要的自给作物之一，是一年生热带块茎作物，其块茎能量含量为 25-30%。因此，山药是东非种植的最重要的自给作物之一，但一直被忽视。
病毒性疾病通常以多重感染的形式发生，是山药生产的主要限制因素，可导致植物发育不良、叶子减少、块茎能量含量降低，并且在单个植物中，产量损失高达 93%。虽然 140 种病毒的成员可以自然或人工感染山药，但迄今为止在非洲只发现了其中 12 种，其中仅报告了 3 种来自东非。这十二个物种中有八个的病毒是种子传播的，这是严重阻碍其有效控制的一个因素。例如，YV 的种子传播可达 2%，病毒（一种山药花叶病毒 (YMV)）的种子传播可达 6.9%，黄瓜花叶病毒 (cMV) 的种子传播可达 13.3%。在非洲其他地方被发现，肯尼亚可能还会发现更多感染山药的病毒。该国对山药感染病毒的了解有限，阻碍了疾病的控制，特别是在无病种子的生产和抗病毒山药品种的培育方面。因此，本研究的主要目的是利用 HTS 和 POX 标记进一步研究肯尼亚山药新病毒的多样性。
问题陈述
肯尼亚种植的薯蓣属物种的问题构成了本研究的基础。这项研究旨在通过分子系统发育来解决这个问题，使用 DNA 和 RNA 核苷酸序列将它们与已知的非洲物种和基因库中包含信息的物种相关联。该研究还针对山药中的新病毒，它会阻碍山药的代谢反应，从而降低含有大量蛋白质的薯蓣苷的水平，从而增加山药的营养价值。
理由
薯蓣是一种重要的粮食作物，因其具有药用潜力。肯尼亚和全球的薯蓣分类学对基于形态特征的分类学家来说非常具有挑战性。有几个原因与薯蓣属物种分类的困难有关。首先，薯蓣的分类具有挑战性，因为物种内分类特征的复杂性和可塑性因此难以识别，并且由于环境变化，病毒导致病毒和山药发生突变。二、薯蓣一直是被全球研究人员忽视的作物。物种的明确分化对于育种目的至关重要。绘制特定生物体的物种图不仅对于保护目的而且对于育种目的都至关重要。分子系统学可通过高通量测序和痘标记将病毒物种定位在薯蓣形态复杂的分类单元中，该病毒容易发生并影响山药的遗传组成，从而降低山药的生产力。