免疫组学研究
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IMGT/HIGHV-QUEST：通过 NGS 高通量和深度测序进行免疫球蛋白 (IG) 或抗体和 T 细胞受体 (TR) 分析的 IMGT® 门户网站

背景 有颌脊椎动物的适应性免疫反应的抗原受体、免疫球蛋白 (IG) 或抗体和 T 细胞受体 (TR) 的数量几乎是无限的（人类每个个体 2.1012 个）。这种巨大的多样性是由可变 (V) 结构域合成的复杂机制造成的，其中包括 V 的 DNA 分子重排、多样性 (D) 和连接 (J) 基因、V-(D)-J 处的 N 多样性连接以及 IG 的体细胞超突变。V结构域的特异性由互补决定区(CDR)、更具体地CDR3赋予。IMGT®，国际 ImMunoGeneT-ics 信息系统®，开发了基于 IMGT-ONTOLOGY 的在线工具，可提供 V 结构域 (IMGT/V-QUEST) 和 CDR3 (IMGT/JunctionAnalysis) 详细而准确的序列分析。然而，在线分析每批仅限 50 个序列。面临的挑战是为下一代测序 (NGS) 高通量和深度测序获得的大量序列提供相同的高质量分析。结果 IMGT® 开发了 IMGT/HighV-QUEST，每批可分析多达 150,000 个 IG 或 TR V 结构域序列，并对多达 450,000 个序列的结果进行统计分析。IMGT/HighV-QUEST 为用户提供：(i) 用于提交和结果检索的友好 Web 界面，(ii) 基于 IMGT-ONTOLOGY 概念和 IMGT 的 IMGT/V-QUEST 和 IMGT/JunctionAnalysis 的高质量详细结果科学图表规则，(iii) NGS 统计分析的标准化框架，基于“结果类别”（“1 个副本”、“超过 1 个”、“单个等位基因”、“多个等位基因（或基因）”、(iv) 详细的标准化统计分析表和直方图（例如，V、D和J使用情况、CDR3-IMGT长度）。结论 自 2010 年 10 月以来，IMGT/HighV-QUEST 已在 IMGT® 主页 (http://www.imgt.org) 上免费供学术界使用。第一年提交的序列超过 1.23 亿条。IMGT/HighV-QUEST 是建立可靠的 IG 和 TR V 域库的关键组件。这些库将有助于不同免疫情况下以及不同 B 和 T 细胞群体的个体免疫特征。他们还将有助于表征组合文库中潜在的治疗抗体。结论 自 2010 年 10 月以来，IMGT/HighV-QUEST 已在 IMGT® 主页 (http://www.imgt.org) 上免费供学术界使用。第一年提交的序列超过 1.23 亿条。IMGT/HighV-QUEST 是建立可靠的 IG 和 TR V 域库的关键组件。这些库将有助于不同免疫情况下以及不同 B 和 T 细胞群体的个体免疫特征。他们还将有助于表征组合文库中潜在的治疗抗体。结论 自 2010 年 10 月以来，IMGT/HighV-QUEST 已在 IMGT® 主页 (http://www.imgt.org) 上免费供学术界使用。第一年提交的序列超过 1.23 亿条。IMGT/HighV-QUEST 是建立可靠的 IG 和 TR V 域库的关键组件。这些库将有助于不同免疫情况下以及不同 B 和 T 细胞群体的个体免疫特征。他们还将有助于表征组合文库中潜在的治疗抗体。这些库将有助于不同免疫情况下以及不同 B 和 T 细胞群体的个体免疫特征。他们还将有助于表征组合文库中潜在的治疗抗体。这些库将有助于不同免疫情况下以及不同 B 和 T 细胞群体的个体免疫特征。他们还将有助于表征组合文库中潜在的治疗抗体。