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苜蓿花叶病毒(AMV)外壳蛋白肽片段在理化和免疫化学水平上的表面可及性信息

戈马斯 VS 和羽衣甘蓝 KV

苜蓿花叶病毒 (AMV) 感染 70 个科的 600 多种植物物种（实验宿主和自然宿主）。外壳蛋白是在理化和免疫化学水平上与生物活性肽建立结构-功能相关性的重要材料，也是观察蛋白质分子进化变化的良好模型。位置 1-MSSSQKKAGGKAGKPTKRSQN-21 处的抗原肽；151-PTHAGMQNQNF-161；苜蓿花叶病毒外壳蛋白22-YAALRKAQLPKPPALKVPVVKPT-44由于具有单一表位，可以在大群体中产生免疫反应，因此最适合亚单位疫苗的开发。在本研究中，我们使用 PSSM 和 SVM 算法来预测 MHC I 类和 II 类结合肽、抗原性、溶剂可及性、