蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

IntGeom：计算蛋白质平面基团之间相互作用几何的服务器

Arumay Pal、Rajasri Bhattacharyya、Maitrayee Dasgupta、Saptarshi Mandal 和 Pinak Chakrabarti

IntGeom 是一个用于计算蛋白质侧链中任意两个平面基团之间相对方向的服务器。IntGeom1 考虑十个平面基团，而 IntGeom2 用于研究含 S 基团和芳香族残基之间的接触。当相互作用发生在两个芳香残基之间或涉及带有 Pro 或 Arg 的芳香环或酰胺侧链时，还研究了任何 C−H⋅⋅⋅π (N−H⋅⋅⋅π) 相互作用的发生。可以显示蛋白质结构上并列的上述类型残基中任意两种之间的所有接触。该软件可从以下网址获取：http://www.boseinst.ernet.in/resources/bioinfo/stag.html。