蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

脂质 MALDI MS 分析可准确区分甲状腺乳头状癌和正常组织

Junsun Ryu、Geul Bang、Jeong Hwa Lee、Seung Ho Choi、Yuh-Seog Jung、Kwang Pyo Kim、Young Hwan Kim 和 Hark Kyun Kim

背景:组织学导向的组织基质辅助激光解吸/电离质谱 (MALDI MS) 已用于识别脂质谱,从而区分癌性上皮和正常上皮。

方法:为了评估血脂谱是否有助于诊断,使用基质 (DHB/CHCA) 辅助激光解吸/电离 (MALDI) 质谱 (MS) 对从甲状腺乳头状癌患者采集的冷冻切除肿瘤样本进行分析,并结合邻近的正常组织样本。

结果:在特征选择 P<0.001 时,癌症和正常样本之间差异表达的脂质峰正确预测了 100 个随机训练到测试分区中测试集样本(7 对)的类别标签,中位类别预测准确度为 100%。此外,14 对癌症和相邻正常样本之间差异表达的脂质峰正确预测了 100% 的验证集样本(8 个样本中的 8 个)。与正常组织相比,甲状腺乳头状癌中磷脂酰胆碱 (PC) 32:0 和 PC 34:1、鞘磷脂 34:1 和几种磷脂酰肌醇过表达,而溶血磷脂酰胆碱 18:3 和溶血磷脂酰丝氨酸 18:1 表达不足。

结论:脂质 MALDI MS 谱可以准确区分甲状腺乳头状癌上皮和正常上皮,并证明其作为诊断辅助的潜力。

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