抗病毒与抗逆转录病毒杂志
开放获取

抽象的

孟买患者队列中 HIV-1 C 亚型逆转录酶和蛋白酶基因的多态性

Ritwik Dahake、Shraddha Mehta、Sneha Yadav、Abhay Chowdhary 和 Ranjana A Deshmukh

目标：发达国家对 HIV-1 的原发/传播耐药率感到震惊。关于 HIV-1 C 亚型突变中某些多态性的有效性存在争议，这些突变与与原发耐药相关且有时被误认为是一致的 B 亚型序列有关。在这项初步研究中，我们确定了印度孟买患者队列中 HIV-1 C 亚型的逆转录酶 (RT) 和蛋白酶 (PR) 基因的多态性。

方法：该研究采用来自 24 名患者（接受过抗逆转录病毒治疗且未接受过药物治疗）的血浆样本进行，采用“自制”半巢式逆转录酶 PCR，然后进行测序和序列分析。斯坦福大学艾滋病毒耐药数据库用于分析和解释多态性和其他耐药突变。我们还分析了PR基因的耐药突变监测 (SDRM) 。

结果： PR基因多态性为0.1337±0.042，RT基因为0.067±0.014，其中PR和RT基因耐药突变率分别为16.6%和12.5%。PR基因的取代率大于50%位于L19、V82、M36、R41、L63、H69、L89和I93位置，RT基因的取代率位于D121、K122、T165、K166、K173、D177、T200、Q207和R211。此外，在 15.0% 的样本中观察到 PR 基因 SDRM。

结论：我们的研究结果与之前的研究结果一致，即来自印度的 HIV-1 C 亚型存在多态性，并重申这些多态性还可能包括一些与耐药性相关的主要和次要/辅助突变。大多数在线可用的耐药数据库都是基于 B 亚型；因此，我们建议建立艾滋病毒亚型特异性耐药数据库，以便在开始抗逆转录病毒治疗之前对耐药性进行常规和明确的监测，特别是在使用蛋白酶抑制剂时。