酶工程
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抽象的

耐盐芽孢杆菌蛋白质的纯化倾向

严少敏和吴光

对特殊用途蛋白质的需求显着增加。这些蛋白质通常通过重组蛋白获得，但其纯化成本高且不易。开发一种预先估计纯化机会的方法非常重要，以便对有问题的蛋白质进行展望。蛋白质的纯化应该与蛋白质的本能特性（包括其3D结构）有关，目前已发现大约540个氨基酸特性。因此，可以根据蛋白质纯化的成功率测试每个氨基酸特性，以找出哪种特性更适合估计纯化倾向。在这项研究中，使用逻辑回归和神经网络模型，针对来自嗜盐芽孢杆菌的 438 种纯化蛋白和 429 种不可能纯化的蛋白，对 535 种特性中的每一种进行了测试。ROC 分析应用于所得的敏感性和特异性。结果表明，氨基酸组成特性通常对估计纯化倾向的帮助较小，而氨基酸理化特性、二级结构和动态特性更有用，并且动态特性更有前景。因此，几种类型的蛋白质特性可以用来确定蛋白质的纯化倾向，并且有可能降低成本并加快微生物和生物技术领域的生产。结果表明，氨基酸组成特性通常对估计纯化倾向的帮助较小，而氨基酸理化特性、二级结构和动态特性更有用，并且动态特性更有前景。因此，几种类型的蛋白质特性可以用来确定蛋白质的纯化倾向，并且有可能降低成本并加快微生物和生物技术领域的生产。结果表明，氨基酸组成特性通常对估计纯化倾向的帮助较小，而氨基酸理化特性、二级结构和动态特性更有用，并且动态特性更有前景。因此，几种类型的蛋白质特性可以用来确定蛋白质的纯化倾向，并且有可能降低成本并加快微生物和生物技术领域的生产。