转录组学:开放获取

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开放获取

国际标准期刊号: 2329-8936

抽象的

嘌呤霉素选择混淆了原代人类成红细胞的 RNA 序列图谱

德瓦斯康塞洛斯

慢病毒转导后进行嘌呤霉素测定是一种广为人知的质量交换和关节测试方法,利用包括人类造血干细胞和祖先细胞在内
的各种细胞类型进行质量交换和关节测试。
尽管其应用广泛,但关于细菌嘌呤霉素
N-乙酰转移酶 (pac) 对哺乳动物细胞群的质量表达可能产生的影响的研究还不够。
这里利用人类​​红细胞生成的高可读性模型分析了嘌呤霉素测定影响转录组谱的潜力
。利用来自六名成年健全人类的必需 CD34(+) 细胞进行分析
贡献者用两种可经济购买的 pac 编码慢病毒载体转导,并与未转导的
对照细胞进行对比。RNA-Seq 质量清晰度概况是在分离的原红细胞阶段创建的
,此时在 R-Studio 编程中使用 DEseq2 检查差异质量清晰度。
转导不同慢病毒载体后,恩人品种之间的质量表达谱与嘌呤霉素选择人群之间的品种之间的
RNA鉴定水平存在巨大差异,差异在
0.1%以下。尽管如此,PAC 质量转导后嘌呤霉素的选择导致了成品的重大变化。
与未转导的对照相比,mRNA 减少了 5%。结果表明,应该考虑
嘌呤霉素测定对 RNA-Seq 转录组谱翻译的影响。

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