蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

Cln1 和 Cln2 之间基于结构的功能区别取决于泛素-蛋白酶体途径

Akiko Suganami、Norio Takase、Hajime Sugiyama、Eric V Virtudazo、Susumu Kawamoto 和 Yutaka Tamura

Cln1 和 Cln2 是子囊菌芽殖酵母酿酒酵母 (S. cerevisiae) 的 G1/S 细胞周期蛋白，在细胞周期中振荡，在 G1 晚期上升，在 S 期早期下降。我们试图阐明 Cln1 和 Cln2 之间功能区别的结构基础。在这里，我们进行了计算机模拟：Cln1-Cdc28 和 Cln2-Cdc28 复合物的三维结构的构建和评估。我们的计算机模拟表明，Cln1 和 Cln2 与 Cdc28 的相互作用处于两种不同的情况下，即 Cln1 和 Cln2 细胞周期蛋白盒中额外氨基酸区域的翻转和翻转构象。我们推测 Cln1-Cdc28 和 Cln2-Cdc28 细胞周期蛋白盒中额外氨基酸区域的这种触发器转换的触发因素可能是通过富含 Pro (P)、Glu (E)、Ser 的序列的泛素化来调节的。 Cln1 和 Cln2 中的 (S) 和 Thr (T)，即所谓的 PEST 基序。此外，我们推测 Cln1 和 Cln2 在酿酒酵母 G1/S 期的功能优势可能是通过触发器转换和泛素-蛋白酶体途径控制的。