蛋白质组学与生物信息学杂志

蛋白质组学与生物信息学杂志
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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

提升翻译规范理念的建议

简·查尔斯·比罗

背景:本研究旨在总结 2000 年至 2014 年间一系列有关核酸和密码子结构、密码子和氨基酸之间的相互作用以及翻译的一般概念的生物信息学观察结果。

方法:在这些研究过程中利用了公共序列和结构数据库以及已建立的生物信息学资源方法。

结果:这些研究为翻译的规范概念提供了新的见解,并表明:1)密码子具有结构,并且第1、2、3个密码子残基的发育和功能是不同的;2) 密码子边界是物理化学定义的;3)密码子和编码的氨基酸之间存在立体化学相容性(拟合);4) 遗传密码(同义密码子)中的密码子冗余为蛋白质合成提供折叠(3D)信息,这是确定氨基酸序列(一级或2D结构)所需信息的补充;5) 冗余遗传密码中有蛋白质组密码;6) mRNA-s协助其自身编码肽的共翻译折叠,即 它们充当核酸伴侣;7) tRNA-s 除了作为密码子和氨基酸之间的适配器的传统作用之外,甚至还有助于折叠信息从 mRNA 到蛋白质的转移(tRNA 循环)。

结论:计算(统计)研究、分子建模和理论生物学考虑表明升级翻译规范概念的可能性和必要性。需要传统实验室确认。

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