转录组学：开放获取
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抽象的

银合欢转录组分析及根、芽高表达基因鉴定

Kazue L. Ishihara、Michael DH Honda、Dung T. Pham、Dulal Borthakur

银合欢（银合欢）是一种快速生长的豆科植物，对各种非生物和生物胁迫具有高度耐受性。由于它能够承受高温和长期干旱，并且能够作为无病植物生长，因此它是研究抗逆遗传学的有趣模型植物。高水平的抗逆性可能与根部某些基因的较高表达有关，根部是养分和水分吸收以及土传病原体感染的主要部位。本研究的目的是表征银合欢的转录组并鉴定可能与耐旱性和抗病性相关的根特异性基因。通过基于 Illumina 的测序和从头组装对银合欢的转录组进行了分析，从根和芽中生成了 62,299 和 61,591 个 unigenes (≥ 500 bp)，分别。通过 4 x 180,000 微阵列分析，比较了根和芽之间 10,435 个 unigene 的表达。根中上调的序列主要以与次生代谢相关的unigene为代表，而在茎中上调的序列主要以与碳水化合物和脂质代谢相关的unigene为代表。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将有助于鉴定银合欢的耐旱和抗病基因。在根和芽之间比较了 435 个 unigenes。根中上调的序列主要以与次生代谢相关的unigene为代表，而在茎中上调的序列主要以与碳水化合物和脂质代谢相关的unigene为代表。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将有助于鉴定银合欢的耐旱和抗病基因。在根和芽之间比较了 435 个 unigenes。根中上调的序列主要以与次生代谢相关的unigene为代表，而在茎中上调的序列主要以与碳水化合物和脂质代谢相关的unigene为代表。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将有助于鉴定银合欢的耐旱和抗病基因。根中上调的序列主要以与次生代谢相关的unigene为代表，而在茎中上调的序列主要以与碳水化合物和脂质代谢相关的unigene为代表。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将有助于鉴定银合欢的耐旱和抗病基因。根中上调的序列主要以与次生代谢相关的unigene为代表，而在茎中上调的序列主要以与碳水化合物和脂质代谢相关的unigene为代表。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将导致银合欢耐旱和抗病基因的鉴定。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将有助于鉴定银合欢的耐旱和抗病基因。与萜类生物合成基因和烟草胺合酶基因具有同源性的unigenes在根中上调了100倍以上，这表明这些基因可能在银合欢的高胁迫耐受性中发挥重要作用。对根和芽中活跃转录序列的编目将导致银合欢耐旱和抗病基因的鉴定。