蛋白质组学与生物信息学杂志
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基于基因组的曼氏沙门氏菌分泌组发现，以识别治疗靶点

Mandage RH、Jadhavrao PK、Wadnerkar AS、Varsale AR 和 Kurwade KK

对曼氏沙门氏菌进行大规模基因组分析的动机是探索发现在寄生虫和宿主界面经常分泌的分泌组的可能性，该分泌组被认为通过抑制免疫反应在寄生中发挥着至关重要的作用，以帮助传染性的扩散。在这里，我们提出了一种有效的生物信息学方法，用于识别受感染宿主免疫反应的曼氏沙门氏菌分泌蛋白组中的候选寄生蛋白。对曼氏链球菌基因组推导的 3,700 种蛋白质进行了分析，以确定是否存在分泌信号肽。我们鉴定了 32 种携带 N 端分泌信号肽但缺乏额外膜锚定部分的蛋白质。值得注意的是，我们鉴定了参与 ATP 合成、氧化还原平衡、蛋白质折叠、糖异生、发育和信号传导、清除和核苷酸代谢途径、免疫反应调节。这些蛋白质中的大多数都定义了它们在免疫学诊断和疫苗设计方面的潜力。本文进行了系统的尝试，以开发一种高效、准确地预测寄生虫分泌蛋白的通用方法。