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一种新的 Cuproptosis 相关 LncRNA 特征可预测食管癌患者的预后

尚鹏、李海鹏、闵静婷、安然、杜娜娜1、李正宏*

引言：食管癌（ESCA）是全球范围内肿瘤相关死亡的重要原因。杯状凋亡是一种新型的细胞死亡方式，不同于其他调节性细胞死亡方式，包括铁凋亡、焦凋亡和细胞凋亡。然而，杯状凋亡在 ESCA 的发生和发展中的作用仍不清楚。

材料与方法：用Perl软件对TCGA数据库中173例食管癌患者的转录组数据和临床资料进行整理和提取，对杯状凋亡相关基因与所有LncRNA进行Pearson相关性分析，通过单因素和多因素Cox回归分析确定预后相关的LncRNA，构建新的预后模型，计算每例患者的风险评分。采用C-指数曲线、主成分分析(PCA)分析和受试者工作特征(ROC)曲线分析评估3-杯状凋亡相关LncRNA(CRLs)模型的预后预测性能，并采用多因素Cox分析评估该模型在整个队列和不同亚组中的预后价值。

结果与讨论：建立包括EWSAT1、AC125437.1、GK-IT1在内的3-CRLs风险评分标准，用于评估ESCA的总生存期（OS）。生存分析及ROC曲线显示该评分在TCGA训练组和测试组中均具有良好的预测性能。采用Lasso回归分析各LncRNA的系数并确定lambda值。采用主成分分析判断3-CRLs是否能明显区分高、低风险样本之间的差距。多因素Cox回归显示3-CRLs特征是OS的独立预后因素。Norman图在预后预测中表现出稳健的有效性。

结论：基于3-CRL的风险特征可用于预测食管癌患者的预后。