国际标准期刊号: 2471-9552
王新辉*、周宝林、秦磊、蒯军、杨方、杨路、张兰芳、孙培生、李广鹏
目的:探讨CCR7在LIHC免疫机制中的具体功能,构建CCR7相关的LIHC患者免疫预后特征(IPS)。
方法:从TCGA数据集中下载LIHC的RNA-seq数据,将样本分为CCR7_H和CCR7_L组。然后进行ssGSEA分析、免疫微环境分析、 HLA基因和检查点基因的表达水平分析。进行差异表达免疫基因(DEIG)并应用LASSO Cox构建CCR7相关IPS。构建了一种新的列线图来预测 LIHC 患者的生存率。
结果: CCR_H组免疫评分、Stromal评分、ESTAMATE评分较高,CCR_L组肿瘤纯度较高。CCR7_H组中HLA基因和免疫检查点基因的表达水平较高。CCR7_H组预后优于CCR7_L组。已识别出 903 个 DEIG。DEIGs主要富集于补体激活、适应性免疫应答、T细胞激活、淋巴细胞分化和细胞因子-细胞因子受体相互作用。IPS由10个基因组成,包括GHV4-59、SCML4、AKR1B10、LINC00426、TRGC1、F2RL2、TRBV10-3、SAMD9L、SLC4A10和ROR2。单因素和多因素Cox分析显示IPS是LIHC的独立预后因素。
结论:构建了CCR7相关的IPS和列线图,并为 LIHC 患者提供预测生存率。本研究为从免疫学角度分析CCR7表达的预后影响提供了新的方法。