蛋白质组学与生物信息学杂志
开放获取

抽象的

二维差异凝胶电泳中观察到的蛋白质表达变化的调整置信区间

Klaus Jung、Gereon Poschmann、Katharina Podwojski、Martin Eisenacher、Michael Kohl、Kathy Pfeiffer、Helmut E. Meyer、Kai Stühler 和 Christian Stephan

差异蛋白质组分析重点关注不同生物群体样本之间表达变化的检测和量化。虽然表达变化的显着性是通过一些统计测试来检测的，但表达变化的强度通常通过一些比率估计来量化，例如“倍数变化”。由于其定量特征，倍数变化对于生物学家来说比统计检验的决定更直观。然而，如果这种变化不显着，强烈的表达变化往往会产生误导。因此，我们建议采用置信区间，并针对多个假设检验进行调整，这自然包括测试决策和量化。调整后的置信区间可用于在多假设检验（例如，多假设检验）中通常考虑的错误率控制下做出检验决策。G。系列错误率或错误发现率）。对于生物学家来说，基于调整后的置信区间的测试决策提供了一种更直观的方法来选择两组之间具有显着表达变化的蛋白质。间隔的长度可用于即将进行的实验的样本量规划。我们的方法主要针对记录的蛋白质表达数据二维差异凝胶电泳。