免疫组学研究
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抽象的

免疫表位本体论：应用于广泛的免疫反应数据库设计

Muthuraman Sathiamurthy、Bjoern Peters、Huynh-Hoa Bui、John Sidney、John Mokili、Stephen S Wilson、Ward Fleri、Deborah L McGuinness、Philip E Bourne 和

表位可以定义为与特定受体结合的分子结构，在免疫反应过程中被识别。免疫表位数据库和分析资源 (IEDB) 项目将编目和组织有关感染性病原体、实验抗原和自身抗原的抗体和 T 细胞表位的信息，其中优先考虑 NIAID AC 类病原体 (http://www2.niaid. nih.gov/Biodefense/bandc_priority.htm）和新出现/重新出现的传染病。内在的结构和系统发育特征，以及与表位与宿主免疫系统相互作用相关的信息都将被编目。描述：为了有效地表示和传达与免疫表位相关的信息，开发了正式的本体论。表位域和相关概念的语义被捕获为类的层次结构，它代表了各种概念之间的一般和专门关系。类及其属性的完整列表可以在 http://www.immuneepitope.org/ontology/index.html 中找到。结论：IEDB 的本体是第一个专门设计用于捕获与免疫表位相关的内在化学和生化信息以及这些结构与源自宿主免疫系统的分子相互作用的信息的本体。我们预计这种类型的本体论和相关数据库的开发将促进对与免疫表位相关的数据的严格描述，并可能最终导致用于描述和建模免疫反应的全新方法。