药物代谢与毒理学杂志
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螺旋 E 和 H 之间的细胞色素 P450 保守序列基序分析：酶功能中关键基序和残基的预测

努曼·厄兹根和桑托什·库马尔

合理的方法已被广泛用于研究活性位点残基在细胞色素 P450 (CYP) 功能中的作用。然而，最近使用随机诱变的研究表明非活性位点残基在 CYP 功能中具有重要作用。对随机突变体的荟萃分析表明，75% 的功能上重要的非活性位点残基存在于螺旋 E 和 H (EH) 之间以及 7 和 11 之间的保守序列基序 (CSM) 之间的整个蛋白质的 20% 中。最近开发了一种方法来研究 CYP2B4 中非活性位点残基的功能作用。此外，我们还鉴定并分析了 EH 区域多个 CYP 家族和亚家族中的 CSM。CSM分析结果显示，CSM 7、8、10和11在CYP1、CYP2和CYP3家族中保守，而CSM 9仅在CYP2家族中保守。对不同CYP2亚家族的分析表明，CYP2B和CYP2C在CSM中具有相似的特征，而CYP2A和CYP2D亚家族的特征则不同。最后，我们分析了CSM 7、8、10和11，这是所有CYP家族中共有的/亚家族分析了 15 个重要的药物代谢 CYP。结果表明，虽然 CSM 8 在这些 CYP 中最为保守，但 CSM 7、9 和 10 却存在显着变异。我们认为 CSM8 在已分析的所有 CYP 中具有共同的作用，而 CSM 7、10 和 11 可能在该亚家族中具有相对特定的作用。我们进一步表明，这些 CSM 通过调节蛋白质的柔性/塑性区域，在底物进入/出口通道的打开和关闭中发挥重要作用。因此，