糖类组学与脂质组学杂志

糖类组学与脂质组学杂志
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国际标准期刊号: 2153-0637

抽象的

使用 HIVE-XLD 分析 NCBI SRA 和 CGHub/TCGA 的短读数据:评估人类蛋白质组中非同义变异的影响

拉贾·马宗德

当前的测序技术正在生成数拍字节的数据,由于分析大数据所需的成本和专业知识,大多数研究界都无法访问这些数据。分析此类数据的另一个障碍是 NCBI SRA 等 NGS 数据存储库中缺乏精选信息。为了应对上述挑战,我们在GWU和美国FDA实施了低成本高性能超大规模数据集成虚拟环境(HIVE-XLD)私有云。将展示变异对活性位点和糖基化位点的影响,以说明大数据与功能对象(例如活性位点、结合位点和途径)整合的力量。

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