国际标准期刊号: 2471-9315
法塔赫·塔泽拉特、贾迈勒·萨阿德、穆里尔·米利特洛、索菲·亚历山德拉·巴伦、米歇尔·德兰古*、西尔万·戈德雷伊*
通过支气管镜检查从一名疑似临床结核病的 25 岁柬埔寨男性患者身上采集支气管肺泡灌洗样本，并接种在 Löwenstein-Jensen 培养基中。研究了快速生长、非显色革兰氏阳性且抗酸细菌的菌落。扫描电子显微镜显示长 1.2 ± 0.29 μm、大 0.58 ± 0.07 μm 的杆菌无法使用常规基质辅助激光解吸电离时间飞行质谱和表型测试（API ® ZYM、API ® Coryne和比洛格®表型微阵列分析）。在体外，分离株对异烟肼、阿米卡星和甲氧苄氨嘧啶-磺胺甲恶唑敏感。全基因组测序产生了 5,703,981 bp 的基因组草案，显示 69.3% 的 GC 含量，其中包含 5,207 个编码蛋白基因和 56 个预测 RNA 基因，包括 3 个 rRNA。rpoB 序列与猿分枝杆菌复合体中副瘰疬分枝杆菌的序列相似性为 93%。基因组序列衍生的 DNA-DNA 杂交、OrthoANI 和泛基因组分析证实，该分离株代表了猿猴复合体中一个未描述的物种。该物种因其分离来源而被命名为柬埔寨分枝杆菌。该分离株保藏于立克次体联合收藏 (CSUR) 中，编号为 CSURP9652。