蛋白质组学与生物信息学杂志
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数字信号处理技术：计算生物功能

诺伯特·恩万科沃 (Norbert Nwankwo) 和侯赛因·塞克尔 (Huseyin Seker)

计算蛋白质的生物功能并以数字形式表示它们是一种有利于药物和疫苗设计的方法。例如，众所周知，疫苗的效力是通过特异性来衡量的，而特异性是由生物识别（亲和力）和敏感性决定的。通过数字信号处理（DSP）技术等程序而不是临床实验来计算疫苗设计中使用的肽的生物识别，不仅为肽的氨基酸序列的操作提供了空间，而且还有助于确定产生的抗体的特异性程度，因此产生的疫苗的效力。这也为优化肽以获得所需的生物学特性提供了机会。此外，通过计算肽类药物的生物功能来比较其效力，是一种更快、更容易且节省资源的药物治疗研究方法。在这项研究中，两种 DSP 技术得到了充分的解释和演示。它们是共振识别模型和信息谱方法。它们用于计算疟原虫肽（P18 和 P32）的一些生理特征，这些肽仍在研究中，是否可能用作设计抗疟疾疫苗的材料。此外，这些方法还用于评估两种 Fusion 抑制剂（恩夫韦肽和西夫韦肽）的药理活性。恩夫韦肽目前用于治疗抗艾滋病毒/艾滋病，而西夫韦肽仍在研究中。我们的计算结果表明与初步临床结果有很强的相关性。他们似乎还表明，以数字形式呈现生物学特征是设计药物和疫苗的一种更简单、更合理的方法，因为与临床实验不同，它可以节省资源和时间。这些方法似乎还有助于简化蛋白质残基的操作，这些残基可用于药物和疫苗的设计和开发，以获得最大的生物学特性。