糖类组学与脂质组学杂志
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原核生物中O-连接糖基化途径酶的多样性、丰度和分布——比较基因组学研究

曼吉特·库马尔和皮蒂·V·巴拉贾

在原核生物中，蛋白质 N- 和 O- 糖基化途径 (GlyPW) 已在一些生物体中进行了实验表征。鉴定其他原核生物中的 GlyPW 对于理解糖基化的作用至关重要。在此，我们报告了一种基于 BLASTp 和隐马尔可夫模型 (HMM) 谱的比较基因组学方法，使用实验表征的 O-GlyPW 酶作为查询序列来识别完全测序的原核基因组中假定的 O-糖基化酶。在 128 种生物体中发现了所有五类酶（即起始酶、修饰酶、延伸酶、翻转酶和寡糖基转移酶）的同源物，而在 52 种生物体中未发现任何这些酶的同源物。许多生物体在所有类别中都具有同源物，但寡糖转移酶除外，寡糖转移酶表现出高度的序列多样性。因此，O-GlyPW 酶同系物广泛流行。128 种生物中大部分是变形菌，其中一半以上是致病菌。同源物的分布模式表明物种和菌株特异性变异以及通过水平基因转移获得同源物。