蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

与某些微生物腈水解酶的特异性和理化性质相关的氨基酸序列的计算机分析

Nikhil Sharma、Rekha Kushwaha、JS Sodhi 和 TC Bhalla

已经对一些芳香族和脂肪族微生物腈水解酶的氨基酸序列进行了计算机分析，以了解某些理化性质以及对芳香族或脂肪族腈的特异性。多序列比对氨基酸序列分析显示芳香族和脂肪族腈水解酶在保守氨基酸的位置特异性存在方面存在明显差异。大多数理化参数的统计分析没有显示两种腈水解酶之间有任何明显的区别。在芳香族腈水解酶中，除了活性位点结构域三联体（Glu、Lys、Cys）之外的保守氨基酸残基是 His-129、Asn-168 和 Arg-174，并且这些残基在脂肪族腈水解酶中被 Arg-129、His -168 和 Lys-174 取代腈水解酶。这两类腈水解酶的理化性质也不同，例如与脂肪族腈水解酶相比，芳香族腈水解酶具有较少数量的氨基酸残基、较低的分子量、较高的pI值、较高的Ala和Cys残基含量。