理论与计算科学杂志

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国际标准期刊号: 2376-130X

抽象的

与糖尿病相关的 CKD 表达数据的计算机分析揭示了生物标志物基因

莫哈末。Murshad Ahmed、Safia Tazyeen、Aftab Alam、Anam Farooqui、Shahnawaz Ali、Md. Zubbair Malik 和 Romana Ishrat

慢性肾脏病(CKD)正在成为全球范围内广泛的公共卫生问题。目前对疾病的焦虑可能是由于潜在致病性的变化。我们研究的目的是提供与糖尿病相关的 CKD 微阵列基因表达数据的详细分析以及生物标志物基因的鉴定。在此,使用 Affymetrix 表达芯片分别鉴定了 22 个 CKD 和 69 个糖尿病样本中的差异表达基因。它进一步概述了在 CKD 状态下观察到的一些主要生物学变化,并描述了使用 GEO 数据集(GSE70528、GSE11045)对 Affymetrix 基因芯片进行质量评估的具体程序,还说明了质量控制包以注释详细分析的可视化。我们鉴定了 CKD 中的 912 个差异表达基因和糖尿病中的 629 个差异表达基因。通过对 CKD 与糖尿病的广泛比较,我们发现了 80 个共同基因,其中 29 个上调,51 个下调。进一步对这80个基因进行NCG分析,发现10个常见基因与各类癌症有关。因此,结果强调了这 10 个常见差异表达基因在将其视为糖尿病、慢性肾病和癌症三种疾病的生物标志物方面的重要性。我们的研究对差异表达基因进行了分类,这些基因可能在 CKD 发病机制中发挥重要作用,并可作为生物标志物。已发现 10 个常见基因与各种类型的癌症有关。因此,结果强调了这 10 个常见差异表达基因在将其视为糖尿病、慢性肾病和癌症三种疾病的生物标志物方面的重要性。我们的研究对差异表达基因进行了分类,这些基因可能在 CKD 发病机制中发挥重要作用,并可作为生物标志物。已发现 10 个常见基因与各种类型的癌症有关。因此,结果强调了这 10 个常见差异表达基因在将其视为糖尿病、慢性肾病和癌症三种疾病的生物标志物方面的重要性。我们的研究对差异表达基因进行了分类,这些基因可能在 CKD 发病机制中发挥重要作用,并可作为生物标志物。

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