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旧世界和新世界猴子分化后人类谱系中人类微小 RNA 基因库的扩展

菊野玲子

人们普遍认为，在真后生动物进化过程中，微小RNA（miRNA）在实现形态复杂性方面发挥了重要作用，因为随着两侧对称动物和脊椎动物基因组复杂性的提高，miRNA库不断增加。特别是，人类的 miRNA 库显着扩展。为了研究 miRNA 在灵长类动物进化过程中如何变化，我们估计了真兽类哺乳动物分化后人类谱系中 1,527 个现存人类 miRNA 的进化起源。我们根据六种非人类灵长类动物（黑猩猩、大猩猩、猩猩、长臂猿、猕猴和狨猴以及三种代表性真兽类哺乳动物）中已知和预测的功能直向同源物的存在和缺失，构建了 miRNA 基因的进化谱：牛、狗和老鼠。通过多个基因组序列比对和 BLAST 搜索，然后进行四个过滤步骤来预测功能直向同源物。在与新世界猴的共同祖先分化之后，旧世界猴的谱系中 miRNA 基因和基因家族的数量急剧增加，其速度比灵长类进化早期阶段高出约七倍。类人猿中 miRNA 和基因家族的扩增速率略有下降。将基因数量与每个进化时期获得的基因家族数量进行比较表明，基因的从头生成，而不是基因复制，对新 miRNA 基因的生成做出了相当大的贡献。通过多个基因组序列比对和 BLAST 搜索，然后进行四个过滤步骤来预测功能直向同源物。在与新世界猴的共同祖先分化之后，旧世界猴的谱系中 miRNA 基因和基因家族的数量急剧增加，其速度比灵长类进化早期阶段高出约七倍。类人猿中 miRNA 和基因家族的扩增速率略有下降。将基因数量与每个进化时期获得的基因家族的数量进行比较表明，基因的从头生成，而不是基因复制，对新 miRNA 基因的生成做出了相当大的贡献。通过多个基因组序列比对和 BLAST 搜索，然后进行四个过滤步骤来预测功能直向同源物。在与新世界猴的共同祖先分化之后，旧世界猴的谱系中 miRNA 基因和基因家族的数量急剧增加，其速度比灵长类进化早期阶段高出约七倍。类人猿中 miRNA 和基因家族的扩增速率略有下降。将基因数量与每个进化时期获得的基因家族数量进行比较表明，基因的从头生成，而不是基因复制，对新 miRNA 基因的生成做出了相当大的贡献。在与新世界猴的共同祖先分化之后，其分化率比灵长类进化早期阶段高出约七倍。类人猿中 miRNA 和基因家族的扩增速率略有下降。将基因数量与每个进化时期获得的基因家族数量进行比较表明，基因的从头生成，而不是基因复制，对新 miRNA 基因的生成做出了相当大的贡献。在与新世界猴的共同祖先分化之后，其分化率比灵长类进化早期阶段高出约七倍。类人猿中 miRNA 和基因家族的扩增速率略有下降。将基因数量与每个进化时期获得的基因家族的数量进行比较表明，基因的从头生成，而不是基因复制，对新 miRNA 基因的生成做出了相当大的贡献。