植物生物化学与生理学杂志
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抽象的

拟南芥 TT9 基因座的精细遗传图谱

Hood MI、Winkel BSJ 和 Pelletier MK

已在模式植物拟南芥中分离出许多透明种皮（tt）或单宁缺陷种子（tds）突变体。这些突变体的特征是种皮中原花青素减少或缺乏，导致种子呈浅棕色或黄色。在 tt 突变体中，除了 tt9 和 13 之外，所有相应的基因都已被克隆。作为确定 tt9 基因座身份的第一步，使用由 tt9 植物之间杂交产生的作图群体进行了精细规模遗传作图。兰茨伯格直立 (Ler) 生态型背景与野生型哥伦比亚 (Col) 植物。几种简单的序列长度多态性开发了标记，并对大量植物进行了分析。对这个作图群体的广泛分析表明，tt9 基因座位于三号染色体上 140,000 个碱基对的区域中。根据拟南芥的 TAIR 10 基因组发布，该区域有 34 个基因。为了确定这些基因中的哪个是 TT9 位点，使用了多种方法，包括候选基因测序、亲本系和 tt9 突变体中候选基因的稳态 mRNA 水平的比较以及 T-DNA 标记的分析线。然而，TT9 基因座尚未根据任何这些分析被鉴定。这表明感兴趣的突变可能位于候选基因的非编码区、微小RNA或作图区间内其他尚未注释的基因中。