蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

控制亚麻 (Linum usitatissimum L) 脂肪酸生物合成的基因家族的全基因组鉴定和表征

Frank M You、Pingchuan Li、Santosh Kumar、Raja Ragupathy、Zhengnan Li、Yong-Bi Fu 和 Sylvie Cloutier

亚麻(Linum usitatissimum L.)是一种重要的作物,具有许多特性,例如富含人类营养必需的 ω-3 脂肪酸。植物(包括亚麻)中的脂肪酸(FA)生物合成涉及由不同基因家族控制的几个连续步骤。利用计算机基因挖掘和比较分析,对与 FA 生物合成相关的 6 个基因家族(包括 KAS、SAD、FAD、KCS 和 FAT)进行了全基因组基因鉴定和表征。我们从亚麻品种中鉴定出 91 个 FA 相关基因。CDC Bethune 基因组,其中七个先前克隆的基因得到了验证。新鉴定的84个FA相关基因包括KAS家族的14个新基因、SAD家族的2个、FAD2家族的13个、FAD3家族的3个、KCS家族的38个和FAT家族的14个。在鉴定的 91 个基因中,有 88 个因最近的全基因组复制事件而被复制,其中 13 个 FAD2 基因被假设是从串联基因复制事件进化而来,随后是全基因组复制事件,并且最近是由单个基因复制事件进化而来。基因缺失。这里描述的六个基因家族在植物中高度保守,并且在古代就已经分化。这些新发现的亚麻基因将为进一步研究FA基因克隆和表达、QTL鉴定、标记开发和标记辅助选择提供有用的资源。这里描述的六个基因家族在植物中高度保守,并且在古代就已经分化。这些新发现的亚麻基因将为进一步研究FA基因克隆和表达、QTL鉴定、标记开发和标记辅助选择提供有用的资源。这里描述的六个基因家族在植物中高度保守,并且在古代就已经分化。这些新发现的亚麻基因将为进一步研究FA基因克隆和表达、QTL鉴定、标记开发和标记辅助选择提供有用的资源。

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