蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

千金子NHX逆向转运蛋白的同源建模与结构分析

巴曼·帕纳西、纳斯林·莫什塔吉、易卜拉欣·托尔克塔兹、阿斯卡·帕纳西和苏迪普·罗伊

真核 NHX 转运蛋白是跨膜蛋白，对细胞稳态至关重要。植物液泡 NHX 逆向转运蛋白被认为参与将 Na+ 隔离到液泡中，从而防止细胞质中 Na+ 的毒性作用。千金子 NHX 反向转运蛋白的一级和二级结构分析表明，该反向转运蛋白是一种含有大量 α 螺旋的疏水蛋白。在本研究中，通过计算机 3D 同源建模研究预测了 NHX 反向转运蛋白的三维结构。通过能量最小化对所得模型进行了细化，并从几何和能量方面进行了质量评估，结果表明具有合理的质量。通过绘制 Ramachandran 图和计算 QMEAN 分数来验证 3D 结构。