蛋白质组学与生物信息学杂志
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疏水分级分离增强了质谱法对三阴性乳腺癌的新型蛋白质检测

Ming Lu、Julian P. Whitelegge、Stephen A.Whelan、Jianbo He、Romaine E. Saxton、Kym F. Faull 和 Helena R. Chang

人们普遍认为，特异性、敏感且可靠的肿瘤生物标志物的发现可以改善癌症的治疗。本研究的目的是开发一种新颖的分级分离方案，针对疏水蛋白作为可能的癌细胞膜生物标志物。通过聚合物反相柱富集乳腺癌组织和细胞系的疏水蛋白。使用混合线性离子阱 Orbitrap，通过纳米液相色谱和串联质谱法洗脱和消化保留的蛋白质以进行肽鉴定。从这三个样本中分别鉴定出数百种蛋白质：肿瘤、正常乳腺组织和乳腺癌细胞系。许多已鉴定的蛋白质定义了关键的细胞功能。对同一患者的癌症和正常组织的蛋白质谱进行了系统检查和比较。三阴性中干细胞标记物过度表达乳腺癌(TNBC) 与非 TNBC 样本进行比较。由于已知乳腺癌干细胞对放射和化疗具有抵抗力，并且可能是 TNBC 患者中常见的转移来源，因此我们的研究可能提供促进 TNBC 侵袭性的分子的证据。使用疏水分级分离和纳米LC质谱分析相结合对这些蛋白质获得的初步结果在发现潜在的癌症生物标志物方面似乎很有前景。如果经过充分改进，这种方法可能有助于乳腺癌的早期检测和更好的治疗。