蛋白质组学与生物信息学杂志
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ICPL_ESIQuant - 用于处理蛋白质组学 LCESI-MS2 实验的强大免费软件工具

阿希姆·布伦纳、约瑟夫·凯勒曼和弗里德里希·洛茨佩奇

在使用稳定同位素标记的基于 MS 的定量方法中，同位素编码蛋白质标记 (ICPL) 技术已成为识别和相对定量复杂蛋白质混合物中数千种蛋白质的强大工具。ICPL_ESIQuant 3.0 软件包是 ICPL-ESI 工作流程的关键组件之一，涵盖 LC-MS 特征检测、ICPL 双峰/三峰/四峰定量等数据处理步骤以及 LC-MS 特征和 Mascot 搜索的合并步骤结果。作为独特的功能，该软件执行同位素模式重叠校正，并利用额外的化学知识（例如 ICPL 标签的物理化学特性）来丢弃假阳性同位素模式，从而显着提高最终肽和蛋白质结果的质量。

ICPL_ESIQuant 是市场上第一个免费软件工具，它支持使用数据相关采集 (DDA) 的鸟枪式蛋白质组学策略和使用质量包含列表进行前体离子选择的定向蛋白质组学策略。

ICPL_ESIQuant 3.0（32 和 64 位版本）可以从 https://sourceforge.net/projects/icplquant/files/ 下载