家禽、渔业与野生动物科学
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采用计算机方法识别斑马鱼中应激相关的分子生物标志物，以获取水产养殖中基于毒性的风险

Md Mursalin Khan*、Ashiqul Islam SM 和 Ahmed Mustafa

鱼类的毒性应激最近已成为水产养殖中的一个主要问题。定期监测风险因素可以使水产养殖者免受大量损失。荟萃分析通过坚定地利用分子生物标志物，为鱼类栖息地中应激诱导化学物质的高通量筛选提供了一种成功的方法。之前报道的荟萃分析揭示了 Top-21 蛋白质通常与应激诱导的蛋白质组谱相关。我们对这些 Top-21 蛋白质的特定功能分类、蛋白质相互作用 (PPI) 网络和共表达谱进行了进一步的计算分析，以寻找更一致、更稳健的分子生物标志物。该分析确定了功能类别特异性分子生物标志物：对于热休克蛋白，建议的生物标志物是 hsp90b1、hsp90ab1、hspa5、hspa8、hspa9 和 ptges3a；对于细胞骨架蛋白，建议的生物标志物是 actb1、myhz2 和 zgc:55461、rac1、tuba1/2、tuba1 和 zgc:136799；对于角蛋白，建议的生物标志物是 Krt 4、Krt5、krt23、krt17、sc:d0144、cldnb、icn2 和 pkp3；对于氧化损伤防御蛋白，建议的生物标志物是 txn、prdx5、adh2a 和 prdx2。这些预测的分子生物标志物可以被认为是识别鱼类栖息地中存在的应激源的潜在候选者，因为生物标志物是应激调节不可或缺的一部分。此外，作为研究的结果，所报道的蛋白质也可以用作鱼类的应激调节剂。我们的研究将帮助研究人员找到适合压力生物标志物和调节剂的蛋白质。