蛋白质组学与生物信息学杂志
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免疫信息学：筛选 H1N1 猪流感病毒蛋白质组中潜在的 T 细胞抗原决定簇，用于病毒表位疫苗设计

帕万·夏尔马和阿贾伊·库马尔

流感(H1N1) 是一种高度传染性的呼吸道病原体，它不断发展并威胁着兽医和人类的公共卫生。目前针对流感（H1N1）的现有疫苗基于主要针对表面蛋白——血凝素和神经氨酸酶的中和抗体形式产生二次反应。在这项工作中，Propred 和 Propred I 免疫信息学工具已用于预测来自七个假定蛋白质的 T 细胞表位。流感病毒 A/明尼苏达/2009 (H1N1) 的血凝素、神经氨酸酶、聚合酶 PA、核衣壳蛋白、基质蛋白、聚合酶 PB1、聚合酶 PB2。总共15个表位预测了 HLA I 类分子的表位和 14 个 HLA II 类分子的表位。这些表位被发现是得分最高的肽，并显示出与最大数量的 HLA 等位基因的结合。该分析中采用的阈值百分比为 4%，以通过 Propred 和 Propred I 选择高亲和力肽。预测的表位可以作为有用的诊断试剂，用于评估自然感染情况下的 T 细胞反应，也可以用于有助于设计针对 H1N1 流感的 DNA 疫苗或亚单位疫苗。