临床和细胞免疫学杂志
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杜文哈奇狂犬病病毒糖蛋白G的免疫信息学-肽驱动疫苗与计算机建模

Sahar Obi Abd Albagi、Omar Hashim Ahmed、Manal Abdalla Gumaa、Khoubieb Ali Abd_elrahman、Ahmed Hamdi Abu-Haraz 和 Mohammed A. Hassan

背景：杜文哈奇狂犬病病毒属于弹状病毒科狂犬病病毒属，可引起致命感染，目前尚无有效的治疗方法，也没有获得许可的DNA或肽疫苗。本研究的目的是预测杜文哈奇狂犬病病毒的疫苗肽。
方法和材料：从NCBI筛选出Duvenahge病毒的序列，然后经过IEDB的多个B细胞和T细胞测试，以实现最有希望作为驱动肽疫苗的肽。利用IEDB对选定的肽进行群体覆盖分析，最后进行同源建模和分子对接研究以可视化与MHC1分子的应答。
结果与结论：在用于T细胞测试的测试肽中，本研究预测了一个有趣的T细胞表位（YFLIGVSAV），另外与18个等位基因结合外，还表现出全部结合亲和力，作为MHC-One和MHC-2等位基因的强烈指示剂人口覆盖率全球99.36%。这些结果得到了分子试点研究的进一步支持，该研究表明与MHC同旋分子具有良好的配合，在测试的肽中发现具有最低的结合能力。只有三个
B细胞表位（AHYK、YTIPDKL和SLHNPYPDSH）与所有进行的B细胞测试重叠，它们是线性的、位于糖蛋白G的表面上并且具有作用性。