蛋白质组学与生物信息学杂志
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负责推迟和加速开花的 FLC 和 FT 基因的计算机功能分析

穆斯塔法·科什哈尔·萨尔马斯特

本文研究了 FLOWERING LOCUS C (FLC) 和 FLOWERING LOCUS T (FT) 基因的计算机功能分析。顺式调控模块及其组织的识别是获得基因表达调控信息的先决条件。因此，本研究通过 PlantPan 和 PLANCARE 服务器对拟南芥及其直系同源物桃中的 FT 和 FLC 基因进行了启动子分析，其中整合转录因子结合位点（TFB）参与激素和应激信号。还研究了光响应元件。在 FT 和 FLC 鉴定的响应元件中，拟南芥的响应元件数量最多。这部分是因为桃树是日中性植物，而拟南芥是兼性长日照植物。MEME服务器对FT和FLC蛋白的基序识别结果表明，FT是高度保守的，但基序的数量表明FLC蛋白具有更多的基序，这可能是由于其更长的氨基酸长度。PlantPan Web 服务器在 FT 和 FLC 启动子分析中发现了一些指定的 TF，例如 AGAMOUS (AG)、AGAMOUS LIKE (AGL)、LEAFY (LFY) 和 APETALA1 (AP1)。它们也出现在蛋白质-蛋白质相互作用网络分析中，该分析提出了 FT 或 FLC 是否可以在反馈环路中作为其自身表达的正调节器或负调节器的问题。PlantPan 网络服务器在 FT 和 FLC 启动子分析中发现了 LEAFY (LFY) 和 APETALA1 (AP1)。它们也出现在蛋白质-蛋白质相互作用网络分析中，该分析提出了 FT 或 FLC 是否可以在反馈环路中作为其自身表达的正调节器或负调节器的问题。PlantPan 网络服务器在 FT 和 FLC 启动子分析中发现了 LEAFY (LFY) 和 APETALA1 (AP1)。它们还出现在蛋白质-蛋白质相互作用网络分析中，该分析提出了 FT 或 FLC 是否可以在反馈环路中作为其自身表达的正调节器或负调节器的问题。