免疫组学研究
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禽痘病毒 (FPV) 肽疫苗的计算机预测

Idris ST、Salih S、Basheir M、Elhadi A、Kamel S、Abd-elrahman KA、Hamdi A 和 Hassan MA

鸡痘病毒（FPV）是双链DNA病毒，是痘病毒科的一员，通过气溶胶和昆虫叮咬传播，引起家禽皮肤和白喉感染。本研究旨在通过计算机分析 NCBI 数据库中报告的所有 FPV140 蛋白序列后选择所有可能的表位来设计肽疫苗接近。将检索到的序列比对后，将保守区域应用到IEDB分析工具中以预测B和T细胞表位，然后测试预测表位与MHC1分子、肽低能的(BF2*2101)(BF2*0401)鸡受体结合的亲和力当与受体对接时，建议作为基于表位的疫苗。肽（50 PPSPKP 55、51 PSPKPL 56、52 SPKPLP 57、53 PKPLPK 58、54 KPLPKS 59、55 PLPKSK 60、56 LPKSKQ 61 和 18 RPSSTV 23）是最有潜力的 B 细胞表位，而（110 YIMDNAEKL 118、274 FYHRMYY） PL 282， 278 MYYPLFSVF 286 231 YVVDNDRYV 239 和 317 LLSGVFLAY 325) 对接表位被认为是 T 细胞表位，因为它们具有良好的结合亲和力，特别是与 110 YIMDNAEKL 118 重叠。这项研究的结论是，这些预测的表位可能用于生产针对 FPV 的良好疫苗。体外和体内研究以评估其效率。