蛋白质组学与生物信息学杂志
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微生物羧酸酯酶：使用计算机方法深入了解热适应

萨姆塔·苏德、尼基尔·夏尔马和泰克·昌德·巴拉

羧酸酯酶（CE）是一组在水存在下催化羧酸酯分子水解形成醇和羧酸的酯酶。对来自嗜温和嗜热生物体的十种羧酸酯酶 (EC 3.1.1.1) 序列进行了计算机分析，以进行各种理化参数和氨基酸比较。从 NCBI 检索 10 条序列，每组 5 条，并使用多序列比对工具 MUSCLE 进行比对。使用MEGA-6的最大简约法发现了两个群体之间的系统发育关系。使用在线 ProtParam ExPASy 工具进一步分析这些序列的一些重要的理化特性。多重序列比对 (MSA) 显示存在保守的催化三联体 S157、D254、H284。使用 MEGA-6 的最大简约法将嗜温酯酶和嗜热酯酶分为各自的亚组。两组的物理和化学性质表现出显着差异。理论等电点和带负电荷的残基在本研究中被发现具有重要意义。氨基酸Gln(Q)、Val(V)表现出显着的统计变化，分别为1.7和1.5倍。折叠值统计显示 Asn (1.4)、Gln (1.7)、Cys (1.4)、Thr (1.3)、Trp (1.4) 和 Lys (1.2) 在嗜温菌中占优势，而 Ala (1.1)、Arg (1.5)、Ileu嗜热菌中的 (1.3)、Glu (1.2)、Tyr (1.2)、Val (1.5)。极性氨基酸残基 Gln (Q)、Asn (N)、Cys (C) Lys (K)、Thr (T) 和 Glu (D) 除了在一组和另一组中占主导地位之外，还有助于区分脂肪酶和酯酶对水溶性短链脂肪酸酯有亲和力。