应用微生物学：开放获取
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抽象的

通过废水基因组学研究氨氧化细菌的微生物多样性

Maulin Pramod Shah 和 Reddy GV

自养氨氧化细菌是工业废水处理系统中微生物群落的关键因素。我们评估了接收相同废水的两个全尺寸处理反应器（砂滤器和曝气生物过滤器）中β-变形菌氨氧化细菌的多样性和群落组成。氨氧化细菌选择性引物的 16S rRNA 基因片段的聚合酶链式反应与变性梯度凝胶电泳相结合，可以对主要氨氧化细菌群体进行比较分析。通过聚合酶链反应扩增的 16S rRNA 基因片段的克隆和测序验证了主要氨氧化细菌的系统发育亲和力。使用基于概率的相似性指数评估变性梯度凝胶电泳图谱。利用相似性概率指数使我们能够考虑在不同样品中氨氧化细菌群落结构中观察到的差异和相似性具有统计显着性，或者可以解释变性梯度凝胶电泳图谱中条带的随机匹配，从而提出随机定植不同氨氧化细菌的反应器。所有可能相似的序列均已识别，并归入亚硝化单胞菌属。在滴滤器中检测到的氨氧化细菌的多样性比所有分析样品的 BAF 的多样性都要高，最初以与运动亚硝化球菌关系最密切的氨氧化细菌为主。