蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

鲤鱼线粒体 COI 基因序列分析及与鲤科七种鲤鱼的比较:系统发育定位和 DNA 条形码作为隐种物种模型研究的发现

RK Garg、Nidhi Dubey、N Batav、Pooja Pandey 和 RK Singh

在过去的三十年里,出于技术易用性考虑以及物种假定的生物学和进化特性的结合,线粒体 DNA (mtDNA) 已被宣布为最流行的分子多样性标记。本研究检测了线粒体DNA的部分线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因序列,以用于Puntius ticto在8个Puntius属物种中的系统发育定位,以及其是否适合确定Puntius属之间的遗传分化。从 Halali 水库采集的 05 个 P. ticto 样品进行了分析,对线粒体部分区域的 mtcox1 基因进行了测序,并与 NCBI(美国国家生物技术信息中心)的在线数据库对其余 7 个物种(P. sophore、 P. sarana、P. 两栖、P. chola、P. conchonius、P. dorsalis 和 P. gelius)。mtcox1 基因 668 bp 的测序揭示了 18 个单倍型 (h),单倍型(基因)多样性 (Hd) 为 0.981 ± 0.023,核苷酸多样性 (Pi) 为 0.658。已记录了 504 个可变位点和简约位点,并且在核苷酸序列中以相同频率观察到保守位置,并且可变区大部分在核苷酸 27 至 76 之间可见。结果得出结论,部分 mtcox1 具有多态性,可以作为潜在的标记确定 Puntius ticto 与其余七个物种的系统发育定位。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。mtcox1 基因 668 bp 的测序揭示了 18 个单倍型 (h),单倍型(基因)多样性 (Hd) 为 0.981 ± 0.023,核苷酸多样性 (Pi) 为 0.658。已记录了 504 个可变位点和简约位点,并且在核苷酸序列中以相同频率观察到保守位置,并且可变区大部分在核苷酸 27 至 76 之间可见。结果得出结论,部分 mtcox1 具有多态性,可以作为潜在的标记确定 Puntius ticto 与其余七个物种的系统发育定位。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。mtcox1 基因 668 bp 的测序揭示了 18 个单倍型 (h),单倍型(基因)多样性 (Hd) 为 0.981 ± 0.023,核苷酸多样性 (Pi) 为 0.658。已记录了 504 个可变位点和简约位点,并且在核苷酸序列中以相同频率观察到保守位置,并且可变区大部分在核苷酸 27 至 76 之间可见。结果得出结论,部分 mtcox1 具有多态性,可以作为潜在的标记确定 Puntius ticto 与其余七个物种的系统发育定位。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。已记录了 504 个可变位点和简约位点,并且在核苷酸序列中以相同频率观察到保守位置,并且可变区大部分在核苷酸 27 至 76 之间可见。结果得出结论,部分 mtcox1 具有多态性,可以作为潜在的标记确定 Puntius ticto 与其余七个物种的系统发育定位。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。已记录了 504 个可变位点和简约位点,并且在核苷酸序列中以相同频率观察到保守位置,并且可变区大部分在核苷酸 27 至 76 之间可见。结果得出结论,部分 mtcox1 具有多态性,可以作为潜在的标记确定 Puntius ticto 与其余七个物种的系统发育定位。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。结果表明,部分mtcox1具有多态性,可以作为确定Puntius ticto与其余7个物种的系统发育定位的潜在标记。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。结果表明,部分mtcox1具有多态性,可以作为确定Puntius ticto与其余7个物种的系统发育定位的潜在标记。目前的调查可能是野生动物科学家对以虚假借口走私受保护物种进行标记的模型研究,以及 DNA 条形码在阻止此类非法贸易中的重要性。

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