蛋白质组学与生物信息学杂志

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国际标准期刊号: 0974-276X

抽象的

个性化放射性蛋白质组学:在从健康对照供体中分离的 CD34+ 辐照祖细胞中鉴定蛋白质生物标志物特征,以通过生育酚琥珀酸酯进行先发制人的救援

Anjali Srivastava、Ximena Leighton、Ofer Eidelman、Joshua Starr、Catherine Jozwik、Meera Srivastava、Harvey B Pollard 和 Vijay K Singh

生育酚琥珀酸酯 (TS) 已被证明可以保护小鼠免受急性辐射综合症的影响,但其确切的作用机制及其在人类中的可能用途尚未得到评估。我们的方法是测试 TS 对来自健康志愿者的 CD34 阳性干细胞的辐射防护特性。我们假设放射蛋白质组学策略可以识别药物依赖性、个性化的放射防护蛋白质组学特征。为了直接检验放射性蛋白质组学假说,我们用 20 μM TS 处理人 CD34 阳性干细胞 24 小时,然后将细胞暴露于 2 Gy 的钴 60 伽马辐射。我们从所有培养物中分离出蛋白质,并使用高通量抗体微阵列 (AbMA) 平台来测量 725 种低丰度蛋白质的浓度。作为体内对照,我们还在祖集落形成单位上使用相同的先发制人 TS 范例测试了小鼠 CD34 阳性干细胞。体外或体内 CD34 阳性干细胞的 TS 预处理挽救了辐射引起的祖细胞集落形成潜力的丧失。我们确定了 725 种蛋白质中的 50 种可以通过 TS 预处理从辐射诱导的还原中抢救出来。Ingenuity Pathway Analysis (IPA) 揭示了修饰后的蛋白质属于表观遗传调控、DNA 修复和炎症主导的类别。我们的结果表明,放射性蛋白质组学可用于利用来自辐射暴露前患者或受害者的原代 CD34 阳性祖细胞的蛋白质特征来开发用于辐射防护的个性化药物。

 

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