蛋白质组学与生物信息学杂志
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使用肽配体库处理蛋白质样品：覆盖范围和一致性

李雷、孙成军、Steve Freeby、Dennis Yee、Sylvie Kieffer-Jaquinod、Luc Guerrier、Egisto Boschetti 和 Lee Lomas

生物样品中的低丰度蛋白质检测是蛋白质组学的主要挑战之一调查。使稀有物种检测成为可能的一种方法是用固相组合肽配体库处理生物样品。然而，配体组合的使用带来了不确定性，因为文库的多样性非常大，从文库中取样的珠子等分试样每次可能不具有完全可比较的珠子种类。因此，高度多样化的文库实验数据的再现性是需要解决的主要问题。本文报告了当以一定的样本与文库比例使用相似和不同体积的文库时的再现性数据。使用各种互补方法（例如二维凝胶电泳、免疫测定）分析配体文库和其他级分的洗脱物和质谱分析。当使用相似和可变的珠体积进行处理时，收集的数据显示样品之间具有高度的一致性。考虑到结果的相似性，分析测定都是相互收敛的。预计这一演示增强了差异蛋白质组学研究，特别是发现感兴趣的蛋白质靶标，可以通过组合肽库有效完成的可能性。