蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

肺腺癌蛋白质组表达数据库：日本蛋白质组学基因组医学数据库的一部分

小西平征尔、常广由香子、茑浩二、栃木尚文、杰玛明彦、广八节男、近藤正

肺癌肺癌是全世界癌症死亡的主要原因，肺癌蛋白质组学研究的目的是揭示癌症表型的分子背景并开发临床相关应用。在这里，我们报告了一个开放访问的蛋白质组表达数据库，该数据库源自对 262 例肺癌病例的研究，使用二维差异凝胶电泳 (2D-DIGE) 和质谱提取的数据。从原发性肿瘤组织中提取的蛋白质用 CyDye DIGE Fluor 饱和染料标记，并使用大幅面电泳装置进行分离，产生 3179 个蛋白质点。凝胶内消化后的质谱鉴定出 487 个蛋白质，对应 721 个蛋白质点。从单个蛋白质点观察到多个蛋白质，单个蛋白质产生多个蛋白质点，表明蛋白质组的多样性。2D-DIGE和蛋白质鉴定的结果以及部分相应的临床病理数据可在公共蛋白质组数据库日本蛋白质组学基因组医学数据库（GeMDBJ Proteomics，http://gemdbj.nibio.go.jp/dgdb）中免费获取/DigeTop.do）。