免疫组学研究
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抽象的

从完整基因组推断β-根瘤菌共生基因的结构和进化

郑建中、王瑞、刘瑞瑞、陈建军、魏强、吴 XY、庞晓文、James EK 和刘 XY

摘要固氮根瘤菌在一百多年前就发现了。它们分为两个进化枝：Alpha和Beta根瘤菌。它们的共生功能是显着的，但从系统发育的角度来看，其起源和进化一直令人困惑。在这项研究中，我们利用从 NCBI 下载的 33 个公开的完整基因序列组，其中包括细菌和古细菌，并重点关注 10 个品种，根据它们的基因组和之前的基因注释构建了他们的共生结构图谱。检查了共生简单基因 nodA 和 nifH 的系统发育。虽然本研究发现与之前研究中的一些假设存在很大的不一致，但我们支持这样的一般概念：β-根瘤菌是豆科植物的原始共生体，但其标志性基因起源于阿尔法根瘤菌的共同祖先。我们通过垂直传播来验证、共生基因的传播和维系，横向转移发挥着重要的（尽管是支持性的）作用。