糖生物学杂志
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迈向基于聚糖的生物标志物癌症研究和发现的综合糖信息学

Sandra V Bennun、Deniz Baycin Hizal、René Ranzinger 和 Michael J Betenbaugh

尽管最近在破译新的癌症分子标记方面取得了一些成功，但仍然明确且持续地需要开发有助于表征现有生物标志物或促进新生物标志物发现的新技术。了解与癌症相关的糖基化变化为这方面提供了一个重要的系统生物学机会。事实上，在过去的十年中，人们对癌症糖基化的兴趣不断扩大，并且与癌症糖基化相关的大量数据正在迅速积累。此外，用于聚糖分析的新的和改进的复杂糖信息学工具、方法和数据库现在提供了研究这些数据的机会，以了解聚糖在癌症糖基化中发挥的作用。在这里，我们总结了糖信息学工具的发展，以支持癌症糖基化和实验糖蛋白质组学方法的分析。此外，我们还讨论了糖信息学在整合和询问不同的高通量聚糖数据集方面所面临的挑战，以便吸收技术并更好地解决癌症糖基化问题。我们还提供了综合糖信息学方法的示例，这些方法可以帮助更好地理解癌症糖基化作为一个复杂的细胞过程。