蛋白质组学与生物信息学杂志
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抽象的

用于高效质谱肽鉴定的两相过滤策略

Hoong Kee Ng、Kang Ning 和 Hon Wai Leong

通过串联质谱(MS/MS)进行肽鉴定是蛋白质组学中最重要的问题之一。高通量 MS/MS 实验的最新进展产生了大量的光谱，肽鉴定过程也应该跟上。在本文中，我们力求通过两阶段过滤策略在存在噪声的情况下实现肽识别的高精度和高效率。我们的算法将光谱转换为高维向量，然后使用自组织图（SOM）和多点范围查询（MPRQ）作为非常有效的粗过滤器从数据库中选择许多候选肽。这些候选肽随后通过基于标签的精确评分函数S 2 进行评分和排名。实验表明，我们的方法对于肽鉴定来说既快速又准确。