唐氏综合征与染色体异常杂志
开放获取

抽象的

PRDM9 锌指的变异与母源 21 号不分离染色体重组的缺失有关

蒂芙尼·蕾妮·奥利弗、坎迪斯·米德布鲁克、阿里尔·哈登、尼伊莎·斯科特、布莱尔·约翰逊、吉莉安·琼斯、克里斯汀·沃克、科林西娅·威尔克森、沙汉娜·萨福德、阿比索拉·阿金塞、通德·史密斯、埃莉诺·法因戈尔德和斯蒂芬妮·L·谢尔曼

含 PR 结构域的蛋白 9 (PRDM9) 的锌指结合结构域 (ZFBD) 的变异与人类基因组中重组位置的改变有关。由于在不分离的 21 号染色体中观察到重组的缺失和位置改变，我们对 21 三体性儿童的母亲进行了 PRDM9 ZFBD 基因分型，以确定该区域内的变异是否与 21 号染色体不分离的重组相关风险相关。 （NDJ）。在我们的方法中，PCR 用于扩增 PRDM9 的 ZFBD，然后对产物进行双向 Sanger 测序。DNA 测序读数进行比对并与先前确定的 PRDM9 等位基因的序列进行比较。卡方分析用于比较病例之间的等位基因频率（N=235，患有母源性 21 三体性儿童的母亲）和对照（N=48，患有母源性 21 三体性儿童的父亲）。我们的分析结果表明，PRDM9 ZF 小等位基因的频率在 21 号染色体 NDJ 且 21q 上无重组的女性中显着增加 (p=0.02)。更重要的是，与 PRDM9 主要 A 等位基因相比，这些次要等位基因在 21q 上显示出更少的预测结合位点。这些发现表明，PRDM9 ZF 中的等位基因变异可能通过导致 21q 重组减少而在 21 号染色体 NDJ 风险中发挥作用。我们的分析结果表明，PRDM9 ZF 小等位基因的频率在 21 号染色体 NDJ 且 21q 上无重组的女性中显着增加 (p=0.02)。更重要的是，与 PRDM9 主要 A 等位基因相比，这些次要等位基因在 21q 上显示出更少的预测结合位点。这些发现表明，PRDM9 ZF 中的等位基因变异可能通过导致 21q 重组减少而在 21 号染色体 NDJ 风险中发挥作用。我们的分析结果表明，PRDM9 ZF 小等位基因的频率在 21 号染色体 NDJ 且 21q 上无重组的女性中显着增加 (p=0.02)。更重要的是，与 PRDM9 主要 A 等位基因相比，这些次要等位基因在 21q 上显示出更少的预测结合位点。这些发现表明，PRDM9 ZF 中的等位基因变异可能通过导致 21q 重组减少而在 21 号染色体 NDJ 风险中发挥作用。